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原著論文 (査読付)

原著論文

  1. Hara, Y., Sugawara, A., Yamada, K.C., Endo, K., Ashitani, S., Igarashi, K., Soga, T., Shinjo, A., and Kuroda H.
    Comprehensive Measurement and Comparison of Ionic Small Molecules Contained in Citrus Unshiu Marc. Using Metabolomic Analysis
    Nippon Shokuhin Kagaku Kogaku Kaishi 67 (12), pp499-513, (2020)
    (DOI)
     

  2. Furukawa, T., Yamasaki, Y., Hara, Y., Otsuki, C., Maki, H., Soga, T., Moriyama, Y., and Kuroda, H. 
    Axis elongation during Xenopus tail-bud stage is regulated by GABA expressed in anterior-to-mid neural tube
    The International Journal of Developmental Biology 63(1-2), pp37-43,     (2019)
    (DOI)
     

  3. Ding, W.Y., Ong, H.T., Hara, Y., Wongsantichon, J., Toyama, Y., Robinson, R.C., Nédélec, F., and Zaidel-Bar, R.
    Plastin increases cortical connectivity to facilitate robust polarization and timely cytokinesis.
    The Journal of Cell Biology (2017)
    (DOI)
     

  4. Sun, Z., Amourda, C., Shagirov, M., Hara, Y., Saunders, T.E., and Toyama, Y.
    Basolateral protrusion and apical contraction cooperatively drive Drosophila germ-band extension
    Nature Cell Biology (2017)
    (    DOI)
     

  5. Suzuki, M., Sato, M.#, Koyama, H.#, Hara, Y.#, Hayashi, K., Yasue, N., Imamura, H., Fujimori, T., Nagai, T., Campbell, Robert E., and Ueno, N. (#contributed equally to this work)
    Distinct intracellular Ca2+ dynamics regulate apical constriction and differentially contribute to neural tube closure
    Development 144, pp1307-1316 (2017) 
    (DOI)
     

  6. Bertocchi, C., Wang, Y., Ravasio, A., Hara, Y., Wu, Y., Sailov, T., Baird, M.A., Davidson, M.W., Zaidel-Bar, R., Toyama, Y., Ladoux, B., Mege, R.M., and Kanchanawong, P.
    Nanoscale architecture of cadherin-based cell adhesions.
    Nature Cell Biology (2017)
    (DOI)
     

  7. Hara, Y., Shagirov, M., and Toyama, Y. 
    Cell boundary elongation by non-autonomous contractility in cell oscillation.
    Current Biology 26, pp2388–2396 (2016)
    (Pubmed)(Altmetric)
     

  8. Hara, Y., Nagayama, K., Yamamoto, T.S., Matsumoto, T., Suzuki, M. and Ueno, N.
    Directional migration of leading-edge mesoderm generates physical forces: Implication in Xenopus notochord formation during gastrulation. 
    Developmental Biology 382, pp482-495 (2013) 
    (Pubmed)
     

  9. Suzuki, M., Hara, Y., Takagi, C., Yamamoto, T.S., and Ueno, N. 
    MID1 and MID2 are required for Xenopus neural tube closure through the regulation of microtubule organization. 
    Development 137, pp2329-2339 (2010) 
    (Pubmed)
     

  10. Shindo, A., Hara, Y., Yamamoto, T.S., Ohkura, M., Nakai, J. and Ueno, N.
    Tissue-tissue interaction-triggered calcium elevation is required for cell polarization during Xenopus gastrulation. 
    PLoS One 5, e8897 (2010) 
    (Pubmed)

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​

 Featured in: 
 

Suzuki et al., 2017:

- National Institute for Basic Biology: Press release (JPN), Press release (ENG)
- Development: Cover image

- Development: Video highlight

​

Bertocchi et al., 2017:

- Mechanobiology Institute: Illuminating the Contacts

​

Hara et al., 2016:

- Mechanobiology Institute: Featured Research from MBI

- The Straight Times: Beautiful Science (Newspaper)

- MRC Clinical Sciences Centre: Biomedical Picture of the Day

- French scientific magazine La Recherche: The 2016 Scientific Album

- Drosophila Image Awards 2017: Runner-up in video category

​

Hara et al., 2013:

- National Institute for Basic Biology: Press release (Jpn) 

- Kagaku Shinbun: News paper (Jpn)

​

Suzuki et al., 2010:

- Develpment: "IN THIS ISSUE" section: http://dev.biologists.org/content/137/14/e1406.full.pdf+html)

解説・総説

学術雑誌等における解説、総説

総説・その他(プレプリント、解説記事など)

  1. Kakizuka, T#., Hara,Y.#, Ohta, Y., Mukai, A., Ichiraku, A., Arai, Y., Ichimura, T., Nagai, T., and Horikawa, K. 
    Cellular logics bringing the symmetry breaking in spiral nucleation revealed by trans-scale imaging.
    bioRxiv (2020) (Preprint)     (#    contributed equally to this work)
    （DOI）
     

  2. Shimada, K., Hara,Y., and Kuroda, H.
    実験モデル生物としてのアフリカツメガエル African clawed frog: A model organism for various studies.
    KEIO SFC JOURNAL 19(2), pp228-247 (2020)     (peer-reviewed)
    (Link)
     

  3. Hara,Y.*
    Contraction and Elongation: Mechanics underlying cell boundary deformations in epithelial tissues.
    Development Growth and Differentiation (2017) (peer-reviewed) [Invited review]
    (    DOI)
     

  4. Hara, Y.*, and Toyama, Y. 
    構造美と機能美I –かたちづくりの力学-.
    国立科学博物館企画展「卵からはじまる形づくり-発生生物学への誘い-」Booklet発生生物学者の渾身の一枚, pp53 & Webpage (2017) [Selected] 
    URL: http://www.jsdb.jp/booklet/24.html
     

  5. 原佑介, 松本健郎, 上野直人. 
    牽引する-組織移動による力の生成と形態形成.
    実験医学 2015年2月号 Vol.33 No.3, 羊土社 (2015) [寄稿依頼有] 
     

  6. 松本健郎, 原佑介, 上野直人. 
    【特集記事:プロジェクトへの道】「ミクロからマクロへ階層を超える秩序形成のロジック」の紹介,  アフリカツメガエル原腸形成に力が果たす役割:組織移動が生み出す力が支える生物の形づくり. 
    日本数理生物学会ニュースレター No.73, 16-19, 日本数理生物学会 (2014) (Download) [寄稿依頼有]   
     

  7. Takagi, C., Sakamaki, K., Morita, H., Hara, Y., Suzuki, M., Kinoshita, N. and Ueno, N.
    Transgenic Xenopus laevis for live imaging in cell and developmental biology. 
    Development Growth and Differentiation 55, pp422-433 (2013) (peer-reviewed)
    (Pubmed)
     

  8. 原佑介 and 倉田智子.
    研究所の生き物たち ”アフリカツメガエル （学名: Xenopus laevis）” . 
    基礎生物学研究所 WEBマガジン （http://www.nibb.ac.jp/webmag/life/lab-living/2012/xenopus.html）(2012)

国際学会発表

国際学会発表

[Oral]

(as a presenter)

  1. ○Hara, Y., Shagirov, M., Lim, K.W., and Toyama, Y. 
    Tension-dependent dynamics of adherens junction components during cell junction oscillation in Drosophila epithelium    . 
    The 50th Annual meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists, Funabori, Japan (May 2017) 
     

  2. ○Hara, Y., Shagirov, M., and Toyama, Y. 
    Fluctuation of cell junctional tension by autonomous and     non-autonomous contractility in Drosophila epithelium. 
    The 49th annual meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists, cosponsored by the Asia Pacific Developmental Biology Network, Kumamoto, Japan (May-June 2016) 
    [Selected talk] [*meeting was cancelled because earthquakes attacked Kumamoto]
     

  3. ○Hara, Y., Shagirov, M., and Toyama, Y. 
    Cell boundary elongation by non-autonomous contractility in non-ratchet-like cell oscillation. 
    The 26th CDB meeting "Mechanistic Perspectives of Multicellular Organization", Kobe, Japan (September 2015)     [Selected talk from poster presentation]
     

  4. ○Hara, Y., Suzuki, M., Yamamoto, T.S., Takagi, C., and Ueno, N. 
    xMIDs and xMig12 coordinately control epithelial integrity through microtubule organization in Xenopus neural tube closure. 
    1st NIBB-EMBL PhD Mini-Symposium 2009, Heidelberg, Germany (October 2009)
     

(as a co-author)

  1. ○Bertocchi, C., Wang, Y., Ravasio, A., Hara, Y., Wu, Y., Baird, M.A., Sailov, T., Davidson M.W., Zaidel-Bar, R., Toyama, Y., Ladoux, B., Mege, R.M., and Kanchanawong, P. 
    Nanoscale organization of cadherin-mediated adhesion on biomimetic cadherin substrate. 
    Mechanobiology, from molecules to tissue, Quy Nhon, Vientam (June-July 2016)
     

  2. Hara, Y., Shagirov, M., and ○Toyama, Y. 
    Tension-Dependent Vinculin Dynamics at Adherens Junction During Cell Boundary Oscillation. 
    Gordon Research Conference--Adhesion: The Cellular Basis of Tissue Homeostasis and Dysfunction, Lewiston, Maine, USA (June 2016)     [Selected from Poster Abstracts] 
     

  3. ○Ueno, N., Suzuki, M., Morita, H., and Hara, Y. 
    Ca2+ dynamics during neural tube formation of Xenopus. 
    The 62nd NIBB Conference "Force in Development", Okazaki, Japan (November 2014)     [Invited]
     

  4. ○Ueno, N., Hara, Y., Shindo, A., Morita, H., and Suzuki, M.
    Tissue-tissue interaction-triggered mechanical stress in the regulation of early embryogenesis.
    The 13th international Xenopus conference, Alberta, Canada (September 2010)     [Invited]
     

  5. ○Suzuki, M., Hara, Y., Yamamoto, T.S., Takagi, C., and Ueno, N. 
    Regulation of microtubule organization by xMID is essential for maintaining tissue integrity in Xenopus neural tube closure.  
    16th International Society of Developmental Biologists Congress, Edinburgh, UK (September 2009)     [Invited]
     

 [Poster]

  1. ○Hara, Y., and Kuroda, H. 物理的振動刺激に対する植物の応答機構の解析ならびに農産物生産手法への応用検討. The 42nd Annual meeting of Molecular Biology Society of Japan, Fukuoka, Japan (December 2019)
     

  2. ○Hara, Y., Shagirov, M., and Toyama, Y. 
    Junctional tension fluctuations and accompanying molecular behaviors involved in epithelial cell boundary deformations.
    The 2nd NIBB-Princeton Joint Symposium "Imaging and Quantitative Biology", Aichi, Japan (October 2019)
     

  3. ○Hara, Y., Shagirov, M., Lim, K.W., and Toyama, Y. 
    Tension-dependent dynamics of adherens junction components during cell junction deformations. 
    Joint Symposium on Bioimaging between Singapore and Bioimaging Society of Japan, Singapore, Singapore (May 2017) 
     

  4. ○Hara, Y., Shagirov, M., Lim, K.W., and Toyama, Y. 
    Tension-dependent dynamics of adherens junction components during cell junction oscillation in Drosophila epithelium. 
    The 50th Annual meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists, Funabori, Japan (May 2017) 
     

  5. ○Hara, Y., Shagirov, M., and Toyama, Y. 
    Fluctuation of cell junctional tension by autonomous and non-autonomous contractility in Drosophila epithelium. 
    Mechanobiology, from molecules to tissue, Quy Nhon, Vientam (June-July 2016)
     

  6. ○Hara, Y., Shagirov, M., and Toyama, Y. 
    Cell boundary elongation by non-autonomous contractility in non-ratchet-like cell oscillation. 
    The 26th CDB meeting "Mechanistic Perspectives of Multicellular Organization", Kobe, Japan (September 2015) [Selected as oral presentation]
     

  7. ○Hara, Y., Tan, S.E., Shagirov, M., and Toyama, Y. 
    Probing the cell-cell junctional tension at different state of cell oscillation. 
    The 2014 MBI-Japan Joint Symposium on The Mechanobiology of Development and Multicellular Dynamics, Mechanobiology Institute, Singapore (December 2014)
     

  8. ○Hara, Y., Tan, S.E., Shagirov, M., and Toyama, Y. 
    Probing the cell-cell junctional tension at different state of cell oscillation. 
    The 62nd  NIBB Conference "Force in Development", Okazaki, Japan (November 2014)
     

  9. ○Hara, Y., Nagayama, K., Matsumoto, T., Suzuki, M., and Ueno, N.
    Physical forces generated by directional cell migration of the leading-edge mesoderm organize notochord formation during Xenopus gastrulation. 
    CDB symposium 2013, Kobe, Japan (March 2013)
     

  10. ○Hara, Y., Suzuki, M., Nagayama, K., Matsumoto, T., and Ueno, N.  
    Analysis of mechanical force generated by leading edge mesoderm in Xenopus gastrulation. 
    Joint Meeting of the German and Japanese Societies of Developmental Biologists, Dresden, Germany (March 2011)
     

  11. ○Hara, Y., Suzuki, M., Nagayama, K., Matsumoto, T., and Ueno, N. 
    Mechanical force generated by leading edge mesoderm modulates collective cell polarization in axial mesoderm during Xenopus gastrulation. 
    The 16th International Conference of the International Society of Differentiation, Nara, Japan (November 2010)
     

  12. ○Hara, Y., Suzuki, M., Yamamoto, T.S., Takagi, C., and Ueno, N. 
    xMig12 and xMIDs coordinately control epithelial integrity through microtubule organization in Xenopus neural tube closure. 
    11th International EMBL PhD Symposium, Heidelberg, Germany (October 2009)

国内学会発表

​

[Oral]

(as a presenter)

  1. ○Hara, Y. and Kuroda, H. 
    物理的振動刺激を活用した リーフレタスの生育促進手法の検討.
    園芸学会令和2年春季大会, 野053, Tokyo, Japan (March 2020)
    [*meeting was cancelled because of the outbreak of Coronavirus Disease CoVID-19]
     

  2. ○Hara, Y., Shagirov, M., Lim, KW., and Toyama, Y. 
    上皮細胞形状ゆらぎに伴う細胞間張力変化と細胞接着分子動態の相互関係.
    Consortium of Biological Sciences 2017 (2017年度 生命科学系学会合同年次大会), 4P1T19-02, Kobe, Japan (December 2017)
     

  3. ○Hara, Y., Shagirov, M., and Toyama, Y. 
    細胞形状ゆらぎに伴う細胞間張力変化と細胞接着分子動態の相互関係 ~ゆらぎから紡ぎだされる上皮の形態形成~.
    The Autumn Symposium 2016 of the Japanese Society of Developmental Biologists (日本発生生物学会 秋季シンポジウム2016), 遺伝研企画 発生と定量, Mishima, Japan (October 2016)
     

  4. ○Hara, Y., Tan, S.E., Shagirov, M., and Toyama, Y. 
    Probing the cell-cell junctional tension at different state of cell oscillation in embryonic tissue. 
    The MBI Student & Postdoc seminar, Mechanobiology Institute, Singapore (November 2014)
     

  5. ○Hara, Y.  
    Toward understanding of magnitude and functions of forces generated by tissue migration. 
    The 3rd Young scientists meeting of Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas “Cross-talk between moving cells and microenvironment as a basis of emerging order in multicellular system”, Nasu, Japan (November 2013)     [Best presentation award]
     

  6. ○Hara, Y., Nagayama, K., Matsumoto, T., Suzuki, M., Ueno, N. 
    Characterization of the physical force generated by the leading edge mesoderm during Xenopus gastrulation. 
    Joint Meeting of The 45th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists & The 64th Annual Meeting of the Japan Society for Cell Biology, Joint Young Scientist Session, Kobe, Japan (May 2012)
     

  7. ○Hara, Y., Nagayama, K., Matsumoto, T., Suzuki, M., and Ueno, N. 
    ツメガエル胚原腸陥入時に先行中胚葉が生み出す機械的な力の機能. 
    The 2nd Young scientists meeting of Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas “Cross-talk between moving cells and microenvironment as a basis of emerging order in multicellular system”, Arima, Japan (March 2012)
     

  8. ○Hara, Y., Suzuki, M., Yamamoto, T.S. and Ueno, N.　
    xMIDs and xMig12 coordinately control epithelial integrity through microtubule organization in Xenopus neural tube closure.
    The 6th SOKENDAI Life Science Retreat, Shizuoka, Japan (November 2009)

 

(as a co-author)

  1. ○Saito, Y., Hara, Y., Nagata, M., Asai, M., Nakamura, N., Kato, K., Yamada, C.K., Iwaki, T., and Wada, T. 
    レタスの生育湿度と光質が鮮度保持に与える影響.
    園芸学会令和2年春季大会, 利019, Tokyo, Japan (March 2020)
    [*meeting was cancelled because of the outbreak of Coronavirus Disease CoVID-19]
     

  2. ○Hamanaka, Y., Hara, Y., and Kuroda, H.
    麹菌コロニーの相互増殖抑制に関わる因子の探索.
    第19回糸状菌分子生物学コンファレンス, Hokkaido, Japan (November 2019)
     

  3. ○Hamanaka, Y., Hara, Y., and Kuroda, H.
    近接する麹菌コロニーが示す成長拒否反応の観察
    第18回糸状菌分子生物学コンファレンス, Niigata, Japan (November 2018)
     

  4. ○Negishi, T., Miyagi, A., Ninomiya, H., Hara, Y., and Ueno, N.
    アフリカツメガエル先行中胚葉 (leading edge mesoderm)における集団的移動における力場の解析.
    The Autumn Symposium 2016 of the Japanese Society of Developmental Biologists (日本発生生物学会 秋季シンポジウム2016), 遺伝研企画 発生と定量, Mishima, Japan (October 2016)
     

  5. ○Ueno, N., Suzuki, M., Hara, Y., Hayashi, K., Nagayama, K., Mastumoto, T. 
    Characterization of forces generated by embryonic tissues during early development. 
    The 86th Annual Meeting of the Japanese Biochemical Society, Yokohama, Japan (September 2013)
     

  6. ○Suzuki, M., Hara, Y., Sato, M., Nagai, T., Campbell, R.E., and Ueno, N.
    The role of intracellular calcium signaling in apical constriction during Xenopus neural tube closure. 
    Joint Meeting of The 45th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists & The 64th Annual Meeting of the Japan Society for Cell Biology, Kobe, Japan (May 2012)
     

[Poster]

  1. ○Hara, Y., Shagirov, M., Lim, KW., and Toyama, Y. 
    上皮細胞形状ゆらぎに伴う細胞間張力変化と細胞接着分子動態の相互関係.
    Consortium of Biological Sciences 2017 (2017年度 生命科学系学会合同年次大会), 4P1T19-02, Kobe, Japan (December 2017)
     

  2. ○Hara, Y., Shagirov, M., and Toyama, Y. 
    Fluctuations of junctional tension and adherens junction molecules during epithelial cell oscillation.
    The Autumn Symposium 2016 of the Japanese Society of Developmental Biologists (日本発生生物学会　秋季シンポジウム2016), Mishima, Japan (October 2016)
     

  3. ○Hara, Y. 
    Toward understanding of magnitude and fucntions of forces generated by tissue migration. 
    The 3rd Young scientists meeting of Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas “Cross-talk between moving cells and microenvironment as a basis of emerging order in multicellular system”, Nasu, Japan (November 2013)
     

  4. ○Hara, Y., Nagayama, K., Matsumoto, T., Suzuki, M., and Ueno, N. 
    Characterization of the physical force generated by the leading edge mesoderm during Xenopus gastrulation. 
    Joint Meeting of The 45th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists & The 64th Annual Meeting of the Japan Society for Cell Biology, Kobe, Japan (May 2012)
     

  5. ○Hara, Y., Nagayama, K., Matsumoto, T., Suzuki, M., and Ueno, N.
    ツメガエル原腸胚における中胚葉の細胞移動が生み出す力の機能解析. 
    The 4th Annual meeting of the Japanese society for quantitative biology, Nagoya, Japan (January 2012)
     

  6. ○Hara, Y., Nagayama, K., Matsumoto, T., Suzuki, M., and Ueno, N. 
    Function analysis of mechanical force generated by leading edge mesoderm in Xenopus gastrulation, 
    The 44th Annual Meeting for the Japanese Society of Developmental Biologists, Okinawa, Japan (May 2011)
     

  7. ○Hara, Y. 
    ツメガエル原腸陥入時に先行中胚葉が生み出す伸展刺激の脊索形成における役割.
    京都大学大学院理学研究科・基礎生物学研究所・分子科学研究所 三機関若手交流会. Kyoto, Japan (February 2011)
     

  8. ○Hara, Y.
    先行中胚葉の生み出す伸展刺激の脊索形成における役割.
    The 5th NIBB Bio-imaging forum. Okazaki, Japan (January 2011)
     

  9. ○Hara, Y.
    Mechanical force generated by leading edge mesoderm modulates collective cell polarization in axial mesoderm during Xenopus gastrulation.
    The 4th Retreat organized by Nagoya University Global COE. Toyohashi, Japan (October 2010)
     

  10. ○Hara, Y., Suzuki, M., Yamamoto, T.S., Takagi, C., and Ueno, N.
    xMig12 controls epithelial integrity through microtubule organization during neural tube closure in Xenopus. 
    The 42th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists, Niigata, Japan (May 2009)

​

(as a co-author)

  1. ○Kuroda, H. and Hara, Y.
    メタボローム解析によるウンシュウミカン含有水溶性成分の網羅的測定と比較.
    園芸学会令和2年春季大会    , P009, Tokyo, Japan (March 2020)
    [*meeting was cancelled because of the outbreak of Coronavirus Disease CoVID-19]
     

  2. ○Negishi, T., Miyagi, A., Ninomiya, H., Hara, Y., and Ueno, N. アフリカツメガエル先行中胚葉 (leading edge mesoderm)における集団的移動における力場の解析. The Autumn Symposium 2016 of the Japanese Society of Developmental Biologists (日本発生生物学会 秋季シンポジウム2016), Mishima, Japan (October 2016)

セミナー等

国内学会発表
セミナー等

  1. ○Kuroda, H., ○Hara, Y., and ○Yamada, C.K.
    AOI・ラボ、始動！2017
    AOIプロジェクト研究発表会2017, Shizuoka, Japan (March 2018)
     

  2. ○Hara, Y.
    My journey towards independence in Academia.
    MBI Career Talk, Singapore, Singapore (July 2017)
     

  3. ○Hara, Y.
    Through the Microscope
    第2回 JASSポスター発表会    , Singapore, Singapore (June 2017)
     

  4. ○Hara, Y.
    上皮メカノバイオロジー：上皮の形づくりを支える細胞レベルの力学と分子動態
    大阪大学理学部生物学科 第358回生物科学セミナー, Toyonaka, Japan (May 2017)
     

  5. ○Hara, Y.
    Junctional tension fluctuation and accompanying dynamics of adherens junction components during cell–cell boundary deformations in epithelia.
    CDB Seminar    , Kobe, Japan (May 2017)
     

  6. ○Hara, Y.
    力学から生物の形づくりを理解する 〜形態形成のメカノバイオロジー〜 (poster)
    第1回 JASSポスター発表会, Singapore, Singapore (July 2016)
     

  7. ○Hara, Y.
    メカノバイオロジーへの誘い.
    慶応義塾大学SFC 講義「細胞レベルの生命科学による革新」第14回 (全15回), Kanagawa, Japan (January 2016) [Invited] (also see "teaching experiences")
     

  8. ○Hara, Y. 
    組織変形を支える細胞境界振動のメカニクス.
    慶応義塾大学SFC 黒田裕樹研究室ラボセミナー, Kanagawa, Japan (January 2016)
     

  9. ○Hara, Y. 
    組織変形を支える細胞境界振動のメカニクス.
    甲南大学フロンティアサイエンス学部 Science Live Ticket Series Part 22, Kobe, Japan (September 2015)
     

  10. ○Hara, Y. 
    Physical forces generated by directional migration of the leading-edge mesoderm assists notochord formation during Xenopus gastrulation.
    Open seminar, Mechanobiology Institute, Singapore (July 2013) (Link)
     

  11. ○Hara, Y., Nagayama, K., Matsumoto, T., Suzuki, M., and Ueno.
    細胞集団の移動と力、その規模と役割を知る 〜ツメガエル胚 原腸陥入をモデルとして〜.
    National Institute for Basic Biology Seminar by Division of Morphogenesis, Okazaki, Japan (June 2012)

競争的資金獲得・受賞等

資金獲得・受賞

[Research Grants Received]
 

2019 − 2019　　 慶應義塾大学SFC研究所: 2019年度 SFC研究所研究展開スタートアップ補助 (700,000 JPY)

2018 − 2018　　 慶應義塾大学SFC研究所: 2018年度 SFC研究所研究展開スタートアップ補助 (1,000,000 JPY)

2010 – 2013        Grant-in-Aid for JSPS Research Fellows (700,000 JPY / year) (KAKEN)


 

[Scholarships, Fellowships, Honors, and Awards]
 

2021/05/28        フラッシュトーク賞: The 5th Area meeting of Scientific Research on Innovative Areas

  "Singularity Biology" (MEXT JAPAN) (Tweet)

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2017/03/30        Runner-up: Drosophila Image Awards 2017 (in Video categories) (Link)

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2016/11/21        第2位: the 8th MBI Microphotography Competition (in image categories) (Result) (see gallery)


2016/11/21        第2位: the 8th MBI Microphotography Competition (in video categories) (see gallery)

 

2015/12/23        最優秀賞: the 7th MBI Microphotography Competition (in image categories) (Result) (see gallery)


2015/12/23        最優秀賞: the 7th MBI Microphotography Competition (in video categories) (see gallery)


2013/11/11        ベストプレゼンテーション賞: The 3rd Young scientists meeting (photo)


2010-2013          日本学術振興会特別研究員: JSPS Research Fellow DC1 (200,000 JPY/month, for 3 years)


2010                   奨学金返済免除: 日本学生支援機構第一種奨学金 (半額)


2008-2009          奨学金: 日本学生支援機構 第一種奨学金 

研究団体・社会団体への貢献、世話人、アウトリーチ等

アウトリーチ等

[世話人等]
 

  1. 代表幹事: Japanese Association of Scientists in Singapore (シンガポール日本人研究者の会, JASS)の幹事会
    　　　　（2016年4月-2017年4月）。
                     会員数 200人超の会を運営、また、シンガポール国内の研究者によるセミナーを毎月開催（参加人数40名ほど）。
     

  2. 幹事: JASS幹事会。セミナー企画担当（2015年4月〜2016年4月）。通常幹事（2017年4月〜2017年7月）
     

  3. 院生会会長: 基礎生物学研究所 総合研究大学院大学生 基礎生物学専攻 平成23年度 院生会 (2011年〜2012年)
     

  4. 代表幹事：第8回 木曽生物学セミナー。名古屋大学付属菅島臨海実験所にて。基礎生物学研究所、名古屋大学、名古屋市立大学からの４０名程度の規模の１泊２日有志セミナーを企画・運営・実行した (2010年8月5-6日)
     

  5. 実行委員: 総合研究大学院大学 平成21年度 研究科専攻横断型教育事業 第６回 生命科学・先導科学研究科合同セミナー (〜2009年11月5日)
     

  6. 実行委員: 総合研究大学院大学 平成21年度 全学総合教育事業 平成21年度 前学期入学式・学生セミナー　(〜2009年4月10日)
     

  7. 実行委員: 総合研究大学院大学 平成20年度 研究科専攻横断型教育事業第2回 総研大ワークショップ (〜2008年11月16日)
     

  8. 企画運営・座長: 日本学術振興会外国人町名研究者招聘事業 分子生物学フォーラムの一環、非公式の「ジェームス・ワトソン　ジョン・スタイツ 大学院生懇談会」にて。当日は参加者最年少ながらも座長を務めた（2008年10月24日）。中日新聞掲載（2008年10月25日）

     

[専門的アドバイス]
 

  1. アフリカツメガエルの発生を解説: 【みんなで数えよう】アフリカツメガエルの細胞分裂〜受精から孵化まで〜基礎生物学研究所×niconicoにて。運営側の１人「研究員YH」として随時解説をコメント 。のべ23万人の視聴者 (2017年5月3〜5日)
     

  2. アフリカツメガエルの発生に関する映像および画像資料を作成・解説・提供: NHK高校講座「生物」にて。提供した素材は実際の下記番組内で使用され、放送された。

  3. 胚準備・twitterを用いた視聴者との質疑応答に協力: アフリカツメガエル胚の発生ネット中継にて（USTREAM TV経由、基礎生物学研究所の広報連携室の倉田智子主催）(2010年6月13日より一週間)(http://togetter.com/li/28980, http://togetter.com/li/29404)

共同研究の発表等

共同研究等

  1. ○Matsumoto, T., Naito, D., Sugita, S., Tamura, A., Hara, Y., Nagyama, K., Ueno, N. Engineering Approaches toward Estimation of Stress and Strain Distributions in Xenopus Laevis Embryos. MBI-Japan Joint Symposium 2014 “The Mechanobiology of Development and Multicellular Dynamics”, Singapore (December 2014) [Invited]
     

  2. ○Murakami, F., Kodaira, A., Hara, Y., Ueno, N., Matsumoto, T., Nagyama, K., and Sugita, S. 内部応力分布推定のためのアフリカツメガエル新鮮胚の瞬時切断・高さ計測法の開発. 日本機械学会東海支部第45回学生員卒業研究発表講演会,  Nagoya, Japan (March 2014)
     

  3. ○Naito, D., Sugita, S., Tamura, A., Hara, Y., Nagayama, K., Ueno, N., and Matsumoto, T. Estimation of tension distribution of Xenopus gastrula epithelium: Measurement of anisotropic properties with laser ablation and rectangular hole indentation. The 23th Frontier seminar of The Society of Life Support Engineering, Tokyo, Japan (Febrary 2014)
     

  4. ○Naito, D., Tamura, A., Hara, Y., Nagayama, K., Ueno, N., and Matsumoto, T. Establishment of the anisotropic measurement of soft tissue elasticity with rectangular hole indentation and its application to Xenopus gastrula. The 26th Bioengineering meeting of the Japan Society of Mechanical Engineers, Sendai, Japan (January 2014)  
     

  5. ○Matsumoto, T., Kitamura, H., Kentaro Ito, Naito, D., Sugita, S., Hara, Y., Nagayama, K., and Ueno, N.. Engineering Approach for the Analysis of Stress and Strain in Xenopus Laevis Embryo, The 23rd CDB Meeting Building multicellular systems from Cellular Cross-Talk, Kobe, Japan (January 2013)
     

  6. ○Sakamaki, K., Suzuki, M., Takagi, C., Hara, Y., Katsuya Kominami, Kumiko Chiba, Hiroshi Y. Kubota, and Ueno, N.. Analysis of programmed cell death in Xenoupus embryos using a FRET-based caspase biosensor. Joint Meeting of The 45th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists & The 64th Annual Meeting of the Japan Society for Cell Biology, Kobe, Japan (May 2012)
     

  7. ○Kitamura, H., Kodaira, A., Hara, Y., Nagayama, K., Ueno, N., and Matsumoto, T. Estimation of stress distribution in Xenopus laevis embryo with an environmental scanning electron microscope, The 24th Bioengineering meeting of the Japan Society of Mechanical Engineers, Osaka, Japan (January 2012)
     

  8. ○Kitamura, H., Ito, K., Hara, Y., Nagayama, K., Ueno, N., and Matsumoto, T. Estimation of stress distribution in Xenopus laevis embryo by multidirectional measurement, Annual meeting of the Japan Society of Mechanical Engineers, Tokyo, Japan (September 2011)
     

  9. ○Ohkura, M., Shindo, A., Hara, Y., Yamamoto, T.S., Ueno, N., and Nakai, J. Visualization of tissue-tissue interaction-triggered Ca2+ elevation for cell polarization during Xenopus gastrulation with improved GCaMP-type genetic Ca2+ probes. The 84th Annual Meeting of The Japanese Pharmacological Society, Yokohama, Japan (March 2011)

     

     

     

     

     

     

     

     

     

教育歴

教育歴

大学等における教育業務

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(特任講師時代)

  1. 講師: 慶応義塾大学SFC 講義「細胞レベルの生命科学による革新」第11回 (全15回)にて授業を受け持つ。 学部学生を対象とし、「最先端の顕微鏡」をテーマに講義。(2019年12月17日)

  2. 講師: 慶応義塾大学SFC 講義「細胞レベルの生命科学による革新」第14回 (全15回)にて授業を受け持つ。 学部学生を対象とし、メカノバイオロジー概論を講義。(2018年1月16日)

​

(ポスドク時代)

  1. 研究所ツアー担当講師: 所属研究所の紹介ツアー、実験紹介セッション担当 (計2回; 2017年1月19日, 2月27日)

  2. 現地担当講師: 甲南大学講義科目協力 in Mechanobiology Institute:

    • エリアスタディーズ V、講義 (学部生対象、2016 年度、0.5 単位担当)

    • ナノバイオ国際演習、講義 (大学院生対象、2016 年度、0.5 単位担当)

    • エリアスタディーズ V、講義 (学部生対象、2015 年度、0.5 単位担当)
       

  3. 講師 (招聘): 慶応義塾大学SFC 講義「細胞レベルの生命科学による革新」第14回 (全15回)にて。 学部学生101名を対象とし、外部招聘講師としてメカノバイオロジー概論を解説。(2016年1月12日) Pics
     

(大学院生以降)

 

  1. 講師: 日本発生生物学会・自然科学研究機構基礎生物学研究所共催の両生類胚操作実習 において講師を務めた。岡崎市内の高校生および教員を対象として、アフリカツメガエル胚を使った発生の観察の補助や胚操作の手法などを指導した。(計４回; 2008年12月, 2009年12月, 2011年1月, 2011年12月) 
     

(学部生以前)

 

  1. ティーチングアシスタント: 静岡大学教育学部の推進する企画、中学校理科授業へのティーチングアシスタント派遣事業にて。申請者はそれに応募し、静岡県三島市立北上中学校に不定期で派遣され、現職の理科教諭と協力して理科授業内容の向上に務めた。(2007年~2008年) 
     

  2. 教育実習/研究授業: 小学校および中学校の教育免許取得課程において、小・中学校合わせて２ヶ月間の教育実習/研究授業を行った。 (2006年~2007年)


 

教育関連の資格等
 

  1. 小学校第一種教員免許 取得 (2008年3月)

  2. 中学校第一種教員免許 (理科) 取得 (2008年3月)

 

 

 

Webpage・新聞・メディア等への掲載

メディア等

NeuroArt wallpaper collection

June 18, 2018

MBF NeuroArtの壁紙コレクションとして、以前に撮影して応募したショウジョウバエの脳の顕微鏡写真が選ばれました。

9個中2個！（中段の左右列2つ)

2017年度のAOIプロジェクト研究発表会

March 10, 2018

2017年度のAOIプロジェクト研究発表会での様子が県内新聞に掲載されました。

こちらをクリック

AOI−PARC一般公開対応

August 21, 2017

​AOI-PARCの一般公開時の対応の様子が静岡新聞に掲載されました。

こちらをクリック

Cover of the Joint Symposium on Bioimaging between Singapore and Bioimaging Society of Japan

May 19, 2017

Joint Symposium on Bioimaging between Singapore and Bioimaging Society of Japan において、原の写真がカバー写真として使用されました。

”発生”特別企画展 展示企画協力

April 03, 2017

日本発生生物学会と国立科学博物館の共催特別企画展”発生”にて、ブックレット内の写真を提供。

「構造美と機能美I」。

Drosophila Image Award 2017: Video Runner-up受賞

March 29, 2017

昨年出版した論文で使用した「ショウジョウバエの背側閉鎖過程における張力推定」に関連した動画が、”Drosophila Image Awards 2017”にてビデオ部門の”Runner-Up"を受賞しました！

The 2016 Scientific Album

December 20, 2016

​原の顕微鏡写真・研究が、フランスの科学マガジン”La Recherche n°519”の”The 2016 Scientific Album"に特集されました。原のページは該当特集のトップを飾っています。

BPoD

December 04, 2016

​原の顕微鏡写真・研究が、MRC Clinical Sciences Centreが主催する”Biomedical Picture of the Day (BPoD)"に特集されました。

所内ポスター化

November 28, 2016

原の撮影した顕微鏡写真が、研究所内の廊下にポスターとなって掲示されました。

8th MBI Microphotograpy Competitionにてダブル入賞いたしました

November 20, 2016

8th MBI Microphotograpy Competitionにてイメージ部門、ビデオ部門の双方で2位受賞いたしました !

InstagramやFacebookページにて原の撮影した顕微鏡写真が紹介されています

November 04, 2016

Instagram: https://www.instagram.com/p/BKHl6HoBjjL/

Facebook: https://www.facebook.com/nus.singapore/posts/10154507100703540

こちらをクリック

8th MBI Microphotograpy Competitionの紹介画像として原の画像が使用されました

October 11, 2016

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NUSのTOPページを飾りました

September 12, 2016

​先日の特集記事へのリンクがNational University of SingaporeのWebページトップに設置されました。

NUS Newsで論文が紹介されました

September 08, 2016

NUS News in the Highlights sectionにて論文が特集されました。

The Straits Times紙に原が撮影した写真が紹介されました

September 08, 2016

The Straits Times紙のBeautiful Scienceセクションに、原が撮影したショウジョウバエのDorsal closureの写真とともに、研究が紹介されました。

MBIのTOPページに出現しました

August 11, 2016

​研究の特集記事へのリンクがMBIのWebページのトップに設置されました。

7th MBI Microphotograpy Competitionにてダブル優勝いたしました

December 22, 2015

7th MBI Microphotograpy Competitionにてイメージ部門、ビデオ部門の双方で優勝いたしました !

論文の内容が科学新聞に掲載されました

October 17, 2013

ツメガエルの原腸陥入に伴う力学に関する論文が、科学新聞第一面に掲載されました。

Watson博士との懇談会の様子が新聞に掲載されました

October 24, 2010

DNA二重らせん構造の発見者の一人であるJames Watosn博士との学生懇談会の様子が中日新聞に掲載されました。

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